Bei ihrer Konzeption vor mehr als 25 Jahren war die Flugwerft Schleißheim für 50 000 Besucher ausgerichtet. Vom Start weg zog die Dependance des Deutschen Museums für Luft- und Raumfahrt aber rund 100 000 Besucher jährlich an - und bei dieser Marke ist es über all die Jahre geblieben. Auch für 2018 bilanziert das Museum etwas mehr als 103 000 Besucher in der Schleißheimer Einrichtung. Zum Rekordbesuch im Deutschen Museum mit 1,4 Millionen Interessenten, dem zweitbesten Wert seit der 100-Jahr-Feier 2003, steuerte das Zweigmuseum auf dem historischen Oberschleißheimer Flugplatz damit gut sieben Prozent bei.
Im Jubiläumsjahr 2017 waren mehr Besucher gekommen, allein zu den Jubiläumsfeierlichkeiten mit großem Fly-in annähernd 12 000. Auch 2016 lag die Besucherzahl mit 115 000 deutlich höher. Die Auslastung der Flugwerft ist trotzdem aktuell kein Thema, von der Museumsinsel heißt es nur: "Klar ist aber auch, dass wir uns grundsätzlich über noch mehr Besucher in Schleißheim freuen würden." Eine neue Attraktion des Museums soll die Transall sein, die gerade für die Ausstellung vorbereitet wird. Das ausgemusterte Bundeswehrflugzeug war im Herbst in Schleißheim gelandet und wird jetzt hergerichtet. Es wird das größte Exponat.