Von Donnerstag an sollen die S-Bahnen und Züge zwischen Ebersberg und Grafing-Bahnhof wieder so fahren, wie es auch im Fahrplan steht. Die Reparaturarbeiten an den Gleisen sind dann, wenn alles wie geplant läuft, abgeschlossen, die täglichen Verspätungen und Zugausfälle hätten somit für die Pendler endlich ein Ende. Die Pendler, die den Filzenexpress nutzen, können noch bis einschließlich Mittwoch ohne Aufpreis einen anderen Weg zwischen Wasserburg und München wählen, wie die Bahn nun mitteilt: Zeitkarteninhaber der Südostbayernbahn können statt über Ebersberg auch über Rosenheim fahren. In Rosenheim müssen sie dann allerdings in den Meridian nach München umsteigen.
Während der Hitzeperiode in der ersten Augusthälfte hatten sich die Schienen auf dem Streckenabschnitt zwischen Ebersberg und Grafing-Bahnhof auf mehr als 60 Grad erwärmt und dadurch so stark verformt, dass die Bahn vorsorglich die Geschwindigkeit reduzierte. Weil dadurch auf dem eingleisigen Abschnitt der Fahrplan nicht mehr einzuhalten ist, müssen entweder die SOB-Züge des Filzenexpress oder die S-Bahnen der Linie S4 frühzeitig wenden, um jeweils Platz zu machen für den Zug des anderen Verkehrsunternehmens. Die Bahn arbeitet bereits seit mehreren Nächten an der Reparatur der Schienen. Der Streckenabschnitt ist laut Bahn besonders empfindlich, weil dort Stahlschwellen und nicht wie zumeist üblich Beton- oder Holzschwellen verbaut sind. Im Jahr 2019 sollen die Stahlschwellen gegen Betonschwellen ausgetauscht werden.
Die Reparatur der verformten Gleise hat bereits in der vergangenen Woche begonnen, gearbeitet wurde nachts, um die Beeinträchtigungen für die Bahnnutzer geringer zu halten. Die vier schadhaften Gleisstellen wurden bereits durch Trennungsschnitte gerichtet und durch Stopfen des Schotterbetts in Lage gebracht. In den kommenden Nächten werden die Schienen nun verschweißt. Dafür muss noch einmal von Montag bis Donnerstag jeweils von 23.30 bis 4.30 Uhr der Streckenabschnitt Ebersberg - Grafing-Bahnhof komplett gesperrt werden. Die ausfallenden Züge werden durch Busse ersetzt. Am Donnerstagmorgen, 27. August, sollen dann wieder alle Züge planmäßig fahren.